פעילות חברת BlueGen מתפרשת על פני תחומים רבים: התפלת מים במתקני התפלה, מתקני מים ושפכים לתעשייה, טיפול בשפכים סניטריים, איסוף ומיון פסולת עירונית מוצקה, אורגנית ויבשה, ואספקת כימיקלים לתעשייה. לBlueGen- בעלות בחמישה פרויקטי ,PPP ביניהם 2 מתקני התפלה פעילים, 2 מתקני מיון וטיפול בפסולת בהקמה, ופרויקט נוסף לטיפול במי תהום מזוהמים. כל העסקים הללו חיוניים לפעילות המשק ולשגרה האזרחית.

החזקות החברה בפרויקטי תשתית לאומית לשנים רבות מבטיחה ל-BlueGen ממד של יציבות עם תזרימים ארוכי טווח והגנות של המדינה. בתחום הפסולת, במקביל לאחזקתה בחברות ק.מ.מ ודקל הפועלות בתחום הפסולת המעורבת והיבשה, BlueGen נמצאת בשלבי הקמה של 2 מתקני מחזור גדולים, שיצטרפו לפעילות הקיימת וצפויים לחזק את מעמדה כאחת משתי חברות הטיפול בפסולת המתקדמות והגדולות בישראל.

החברה פועלת דרך שלוש חטיבות עיקריות: